决策就是决定和策略或办法。科主任主持科室工作，行使一把手的责任与权利，其作用是不可替代的。决策是科主任的重要职能，决策过程是对科主任基本素质进行检验的过程，是科主任运筹科室，规划科室，驾驭科室持续发展的方略。 
在决策中能体现出诸多的领导艺术和领导方法。科主任决策水平主要体现在以下三个方面。

1、慎重决策 
任何决策都不可能盲目草率，必须慎之又慎。科主任的决策往往是一件事情、一个科室兴衰成败的关键。 
在抢救病人中，科主任制定的抢救方案与病人的生命息息相关;在科室建设中，科主任制定发展目标关系到整个科室的前途命运;在人才培养中，科主任的培养规划关系到专业学科发展建设;在设备购置中，科主任的购置计划关系到设备是否能在最短时间内发挥最大效益。 
因此科主任必须以对病人、对科室、对事业、对历史高度负责的精神，认真而又慎重地决策，在全面、科学、有效上作文章。 
2、科学决策 
科主任不仅要有渊博的医学知识，丰富的临床经验，精湛的医学技术和掌握本专业前沿知识的能力，还必须开放思维，有较强的预测、分析、综合判断能力。 
在经济高速发展、交往日益频繁的现代社会。具有科学的超前思维尤其重要，但超前不能脱离现实，不能忽视客观，更不能凭空想像，必须是科学导航，周密设计。因此必须树立科学的发展观，善于听取专家学者的意见，注重发挥他们的作用。 
这是减少失误，科学决策的基础与保证。如对疾病的诊治，必须遵循循证医学的原则，按科学办事，减少失误。 
3、公正决策 
古语道：“仁者在位而仁人来，义者在朝而义士至。”科主任要去私利，存公心，从科室建设出发，从病人利益出发，不为个人利益所动。
 要最大限度地赢得民心，得到员工和病人的喜爱。为此，在敏感问题上应秉公办事，坚持原则;在处理问题中不能你疏我亲，顾此失彼;在工作中要严格要求自己，树立好“公则明，廉则威”的良好形象。